花呗的自动还款功能，会根据还款顺序自动扣款，由于余额宝在扣款顺序里，因此花呗自动扣款时，会从余额宝中扣钱用于还款。用户提前将钱转入余额宝中用于自动扣款，这样既可以确保按时还款，又可以获取一定的收益。

而用户设置了支付顺序，比如说先扣银行卡再扣余额宝，当银行卡中的钱足够归还花呗欠款，系统就不会再从余额宝中扣钱。