支付宝备用金逾期会降低综合评分，影响支付宝其他产品的使用，比如花呗、借呗，但是对还款没有影响。所以备用金逾期花呗是可以正常还款的，只要确保还款账户里有足够充足的钱。

系统会在花呗还款日当天先进行自动扣款，要是额度不足导致扣款失败，用户就必须在还款日24点前手动还款成功，否则花呗也会逾期的。