花呗账单分期了，但是系统仍然发起了自动扣款，说明用户当月的花呗账单中有部分账单金额是不支持分期还款的。已经分期的金额，会从下月开始还第一期，而未分期的金额在当月仍然需要还款。因此，在分期后系统仍然自动扣款了，也是用于归还花呗的欠款。

另外，除了逾期费、最低还款循环利息、分期手续费和分期出账本金部分，其余的金额都是可以分期的。