公积金账户钱不够扣还是会在还款日当天从银行卡扣的，具体扣款时间以银行为主。

办理公积金贷款会选择冲贷方式，选的是按月冲还的，每个月会委托银行从公积金账户划账到还款卡里进行扣款。要是公积金账户余额不足以扣款，银行就会直接从提供的还款卡里扣钱，贷款人最好是在还款日前一天往银行卡里存够钱。