房贷晚了一天，第二天系统是会自动扣款的。在还款日当天，系统会自动从还款银行卡中进行扣款，如果卡内余额不足，会先将卡内的余额全部扣走。等到了第二天，系统会继续划扣卡内余额，直到划扣金额与还款金额相同为止。

房贷晚还了一天属于逾期还款，这时候系统不仅会划扣还款金额，还会划扣逾期的利息。