重庆商转公必须先还清。重庆商业贷款转公积金贷款的规定是用户必须提前还清商业贷款，之后再申请公积金。由于贷款房屋已经抵押给银行发放商业贷款，而一套房屋不可以抵押给两个贷款机构，因此必须先还清商业贷款，办理解除抵押手续，之后重新申请公积金贷款并办理抵押。

公积金贷款与商业贷款相比较，公积金贷款的利率更低，能申请公积金贷款，建议优先申请公积金贷款，公积金贷款可以有效帮助用户节约购房成本。当然，商转公还必须满足公积金贷款的申请条件，如果不满足贷款条件，那么用户将无法办理商转公。

重庆商转公成功后，后续可以办理公积金对冲业务，公积金对冲是使用公积金账户内的余额归还房贷。