房贷商业贷款还清两年后，如果用户满足当地的公积金提取条件，那么就可以提取公积金。而用户不满足公积金提取条件，不管之前的商业贷款有没有还清，用户都是无法提取公积金的。公积金提取只与用是否满足公积金提取条件有关，与之前的房贷有没有还清无关。

每个地区公积金提取条件可能会有差异，具体请以当地公积金中心规定的提取条件为准。