如果用户申请的是商业贷款，公积金停交，对于商业贷款没有任何的影响。而用户申请的是公积金贷款，已经放款了，这时候不管是公积金提交还是封存，都不会影响到用户已经放款的公积金贷款。除非当前正在申请公积金贷款，停交的话会直接影响到贷款审核结果。

当然，如果没有特殊的原因，最好不要停交公积金，以免以后申请公积金贷款时无法通过审核。