首套房贷款还清，二套房的房贷利息不能用于抵扣个税。用户的房贷只要执行的首套房贷款利率，那么就可以用于抵扣个税。而首套房贷款已经还清，之后再申请房贷，房贷利息已经不符合抵扣个税的要求。用户提交个税抵扣申请后，系统还会对用户进行审核，非首套房是无法通过审核的。

因此，请在首套房还贷期间申请抵扣个税。